1988年，阮祥燕获得新乡医学院医学学士学位，毕业后，她进入河南新乡医学院第一附属医院妇产科任住院医师，在此期间，她结婚生女，家庭幸福美满。1991年7月的一天，阮祥燕的硕士录取通知书和她的女儿同时来到她的面前，这让她犯了难，难道要和刚刚生下的女儿分开吗？最后，为了追求自己的梦想，她克服种种困难前往西安医科大学攻读妇产科学硕士学位。
“书山有路勤为径，学海无涯苦作舟”，阮祥燕凭借刻苦努力和勤奋学习，拿到了硕士学位，紧接着又考入华西医科大学攻读博士，专业依然是妇产科。博士毕业后，她一个人带着女儿来到重庆，在重庆医科大学做高强度聚焦超声治疗妇科肿瘤的研究。1999年，阮祥燕博士后出站后，被引进到首都医科大学附属北京妇产医院，负责创建中国首个更年期综合指导中心与妇科内分泌科。
就这样，阮祥燕像是一只候鸟般在全国南北辗转，作为北京妇产医院第一个引进的博士后，成为内分泌科创始人，她展开了对女性更年期保健与激素治疗的规范临床与研究。仅用两年时间，北京妇产医院在全国率先建立妇科内分泌科，为更年期与妇科内分泌相关疾病的规范管理与研究奠定基础。在此期间，阮祥燕深入研究了妇科内分泌疾病对女性生命健康的不良影响以及如何有效提高妊娠率、预防远期并发症等，她还撰写了《妇科内分泌学热点聚焦》、《生殖内分泌学热点聚焦》、《更年期相关症状及疾病防治理论与实践》、《妇科内分泌病例评析》、《生殖内分泌学临床实践》、《更年期与妇科内分泌疑难病例评析》、《门诊微型宫腔镜诊断技术》7部论著与科普书《女人要懂内分泌》2版，研究成果被多部临床指南及共识引用。
“女性健康守护神，白衣天使不虚名”。很快，阮祥燕的名声就传开了，很多患者慕名而来，在众多患者中，她发现我国女性乳腺癌发病率正在逐渐上升。于是在2010年，阮祥燕与德国图宾根大学合作研究激素与乳腺癌的风险，发现孕激素受体膜组分1在激素与乳腺癌发病机制中起着重要作用。她通过体外不同的乳腺癌细胞系3种雌激素和12种孕激素和不同激素方案刺激实验、在体动物移植瘤不同激素刺激肿瘤生长实验和数百例乳腺癌患者的临床研究，明确了PGRMC1促进乳腺癌增殖的作用，首次检测出患者血液PGRMC1水平与乳腺癌组织中PGRMC1的阳性表达呈明显正相关，PGRMC1在早期和晚期乳腺癌患者中均有非常高的预测价值，继续深入研究有望将PGRMC1发展为乳腺癌风险的一种新型标志物。
此外，阮祥燕还牵头负责与本专科有关的国家级和省部级科研课题40项以上，明确了女性绝经相关代谢、体成分方面的改变及慢性疾病的发生风险。针对激素治疗对更年期女性的获益与风险进行系列研究，明确了激素治疗用于更年期女性的必要性与安全性，打破了“更年期是女性正常生理阶段不需要药物治疗”的传统看法。2011年中国医院协会和中华医学会联合将中国首个“绝经门诊项目中心”授牌给北京妇产医院内分泌科，成为全国绝经相关问题规范化保健治疗培训基地；2017年成为首批北京市更年期保健专科示范单位，2020年获批国家更年期保健特色专科建设单位。
早发性卵巢功能不全（premature ovarian insufficiency，POI）是指女性在40岁以前出现卵巢功能衰退，传统认为POI患病率约1％，有报道称POI的患病率显著升高，可高达3.7％～10％。POI不仅引起女性生育力的丧失，还会导致过早出现绝经相关症状。此外，雌激素缺乏会引起绝经相关的心血管疾病、骨质疏松、老年性痴呆等患病率明显增高，早死风险也明显增加。不仅严重影响患者生活质量，也威胁患者的生命健康，增加家庭及国家的医疗负担。因此，POI被称为比癌症更棘手的疾病。POI常见病因包括医源性、遗传、免疫、环境和特发性因素等。其中医源性因素占50％以上，医源性因素包括肿瘤的放化疗、需要骨髓移植的良恶性疾病（如再生障碍性贫血、地中海贫血、白血病）、子宫内膜异位症等。卵巢组织冻存与移植技术是近年发展起来的防治医源性POI最有前景的方法，已经成为国内国际研究的热点。
一名好医生，不光能为病人看病，还要去研究、探索，放眼未来和世界，带动学科前进。阮祥燕在2010年于德国访问学习期间发现了卵巢组织冻存与移植技术，该技术是在患者放化疗前，通过微创手术将部分卵巢组织取出体外，然后利用低温生物学原理使卵巢组织处于休眠状态，待患者肿瘤治疗完成后再将冻存的卵巢组织移植回体内，从而避免了放化疗对于卵巢功能的破坏。这是那时性腺毒性治疗无法延迟的女性以及青春期前女童唯一的生育力保护方法。该技术在欧洲发达国家已是癌症患者生育力保护的临床常规，但当时在我国仍是空白。
阮祥燕意识到，若将该技术引进国内必将造福千万家庭，她当即决定将此技术引进国内。为了挽救无数患者与家庭，她克服种种困难，在北京市医管中心、北京市卫健委、市科委、国家外国专家局、国家科技部等的项目支持下，于2012年4月支持在北京妇产医院创建了中国首个卵巢组织冻存库。2015年1月开始了卵巢组织冻存的临床研究；2016年9月9日阮祥燕团队终于成功完成了中国首例冻存卵巢组织移植手术。
一位29岁的患者李女士，2016年4月被诊断为骨髓增生异常综合征，唯一根治方法是骨髓移植，但骨髓移植前需要大剂量清髓化疗，会导致几乎100％的卵巢功能早衰，使患者永久失去生育能力。当时李女士还未结婚生育，为了保存生育能力，她尝试冻卵，历经2周的促排卵刺激，也没有优势卵泡生长，冻卵的希望破灭了，而骨髓移植入仓时间紧急，经血液科专家介绍及本人查询，她找到了阮祥燕要求冻存卵巢组织，阮祥燕立即给她加号，一路绿灯，团队抢在李女士化疗前为她进行了卵巢组织冻存。李女士是幸运的，骨髓移植很成功，但骨髓移植后她的卵巢功能彻底衰退了，2018年9月，阮祥燕团队为她进行了冻存卵巢组织自体移植。2020年12月31日，李女士在阮祥燕门诊检查中确定自然妊娠；2021年8月31日，中国首例冻存婴儿诞生，李女士成为中国冻存卵巢组织移植后首例成功自然妊娠的患者。
看着活泼可爱的孩子，阮祥燕激动不已，“孩子的诞生，意味着卵巢组织冻存移植技术在中国真正实现了落地生根、开花结果！”此项技术的成功，填补了中国此领域的空白。据统计，我国每年有数百万年轻女性与儿童面临医源性卵巢早衰风险，而卵巢组织冻存与移植是儿童与放化疗不能延迟的育龄女性生育力保护与保存的唯一方法。截至2023年2月，北京妇产医院卵巢组织冻存库已冻存卵巢组织400多例，年龄最小的患者只有1岁3个月。移植的10例全部成功，移植成功率100％，达到国际领先水平。
正是阮祥燕带领团队历经十余年艰苦努力，在中国首先将卵巢组织冻存技术实现了从临床试验到临床常规的重大科技转化。卵巢组织冻存所有相关项目收费都是基于国家坚持医院惠民与公益性的原则，根据严格的成本核算制定的。目前，卵巢组织冻存相关项目的收费与一个周期试管婴儿的收费差不多。标志着中国卵巢组织冻存移植技术在北京妇产医院已是保护女性生育力与卵巢内分泌功能的临床常规，实现了科学研究的重大转化，积极推广应用将造福千千万万个不幸的患者与家庭。
为了规范该技术在全国的应用与推广，阮祥燕牵头制定了中国首部《卵巢组织冻存与移植中国专家共识与指南》，并且制定了《妊娠期乳腺癌患者生育力保护专家共识》、《造血干细胞移植女童患者生育力保护中国专家共识》、《特纳综合征中国专家共识》。因为在医学上的突出贡献，阮祥燕先后获得中华人民共和国国务院授国务院特殊津贴，北京市三八红旗奖章、首都十大健康卫士，其团队卵巢组织冻存技术的临床应用与推广相关项目获首都医科大学新技术新产品一等奖、第六届中国创新挑战赛（北京）赛区优秀挑战者奖一等奖、中国发明协会发明创业奖成果奖一等奖。
作为一名医者，阮祥燕科研创新成绩斐然；作为一名女人，她付出了比别人更多的努力，正是因为这样的付出，她才获得一项又一项令人羡慕的成功。走过漫漫人生路，她看过太多受苦的患者和不幸的家庭，她的梦想很简单，就是守护百姓健康、造福每个家庭。未来，她和她的团队将以更加坚定的步伐在医学之路上砥砺前行。